يعتمد نظام الجودة بمعامل الشمس على مواكبة تطبيق متطلبات نظم الجودة العالمية لضمان صحة ودقة نتائج التحاليل :

أولاً:  ISO15189 الخاص بإعتماد المعامل الطبية والمُعترف به عالمياً في مجالالتحاليل الطبية .

ثانياً: JCI )Joint Commission International ) وهى نظام الإعتماد الامريكى .

ثالثاً : تشارك معامل الشمس في ثلاث برامج عالمية لضبط الجودة وهى :

• RIQAS: المعتمد من هيئة الاعتماد البريطانية.
• EQAS: المعتمد من الهيئة الأمريكية للمعامل .
• CAP: المعتمد من كلية الباثولوجيين الامريكية  .